常见问题
计算资源使用要求
不要在登录节点直接运行计算任务。示例中的分区、节点数、核心数和路径必须按当前账号权限及实际算例修改。
零、使用前须知-不得在登录节点运行算例程序
用户登录到集群后,使用的节点为login登录节点,登录节点只能用来进行编辑编译工作,请不要在登录节点直接执行计算程序。请使用作业提交脚本将程序调度到计算节点上运行算例程序,参考作业提交部分。
如在登陆节点直接运行程序,管理员有权杀掉程序进程,次数过多则封禁账号限制登录,敬请遵守规定!有编译需求的用户,编译进程请控制在2个以内,避免登录节点负载过高影响大家的使用体验,谢谢配合!
一、 DOS UNIX格式问题导致的提交失败
# sbatch: error: Batch script contains Dos line breaks
# sbatch: error: instead ofexpected UNIX line breaks
报错如上,解决方法是将文本dos格式转换为unix格式
module load dos2unix
dos2unix file
# 将file改为实际要转换的文件,然后重新sbatch该文件即可
二、 提交作业有足够的节点,为什么会有延时?
这是因为slurm会进行调度,偶尔会有正常的等待时间,这是正常的。
三、提交报错
sbatch: error 可能是因为核心配置,以及作业分区编辑错误
#### 分区指定错误 sinfo 查看可用队列 多个队列情况下 联系对接人确认
sbatch: error: invalid partition specified: debff
sbatch: error: Batch job submission failed: Invalid partition name specified
##### 核心配置错误 单节点最多56 总核心数为节点数承单节点所有核心数
sbatch: error: Batch job submission failed: Requested node configuration is not available
四、取消作业
取消作业请使用 以下命令进行取消,直接删除文件夹,作业会继续运行,会继续使用机时
squeue
JOBID PARTITION NAME USER ST TIME NODES NODELIST(REASON)
9446 intel01 bash shizs R 4-19:20:08 1 n03521
scancel 9446
五、图形化界面
在集群环境中,所有操作均以命令行形式进行,集群无图形化界面
六、关于数据删除
由于linux数据删除为不可逆操作,无法进行数据恢复,进行删除操作前请谨慎操作
七、集群联网问题
为保证客户数据安全,集群不与互联网互通,git与wget等网络下载命令无法使用,软件安装包均需从本地电脑有网环境下载后上传到集群
八、yum形式安装软件
集群用户无root权限如需yum安装指定库等请联系技术支持人员进行流程申请后技术支持人员协助安装或自己进行源码包安装
九、关于密码登陆
使用mobaxterm等ssh工具登录集群时,输入密码时不显示字符为正常现象,正常进行密码输入即可
十、关于数据传输
1. 需要上传下载的计算数据量过大时,建议源数据超过100GB使用邮寄硬盘的形式进行数据传输,这样可以避免网络传输速度慢或网络波动导致数据传输中断
2. 移动硬盘数据传输速度与USB2.0,3.0,硬盘的类型,数据小文件数量的多少都有关系
3. 若数据为单个大文件传输服务器传输速度约为100到150MB/s,若为多个小文件传输服务器传输速度约为10到20MB/s
十一、账户更新密码
如有需求,在本地个人目录下,输入cepasswd即可修改登录密码,修改成功后再次登录集群请使用新密码。
密码设定要求:最少8个字符,必须包含数字、字母、特殊字符(!@#$%^&*?_)
十二、查询存储空间使用情况
lfs quota -hu $USER $HOME