parallel-sbatch

批量提交作业脚本

#!/bin/bash
for file in ./*
do
    if test -d $file
    then
        cp run.slurm $file
        cd $file
        chmod +x ./run.slurm && sbatch ./run.slurm
        cd ..
        sleep 1s
    fi
done

#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=1                    # 节点数量
#SBATCH --ntasks-per-node=56         # 每个节点核心数量
#SBATCH --ntasks=56                  # 总核心数
#SBATCH --partition=g1_cae           # 队列分区且必须指定正确分区
#SBATCH --job-name=sp-b1             # 作业名称
#SBATCH --output=sp-b%a.out.%A       # 正常日志输出 (%A 参数值为 jobId, %a 参数为inp文件的号)
#SBATCH --error=sp-b%a.err.%A        # 错误日志输出 (%A 参数值为 jobId，%a 参数为inp文件的号)
#SBATCH -a 1-5                       # 1-5 表示inp文件的区间


file=sp-b${SLURM_ARRAY_TASK_ID}      # inp文件的格式前缀
echo "${file}.inp run in `hostname`"
echo "This is job #${SLURM_ARRAY_JOB_ID}, with parameter $SLURM_ARRAY_TASK_ID"

abaqus job=${file} input=${file}.inp analysis cpus=$SLURM_NPROCS scratch=$SLURM_SUBMIT_DIR interactive
sleep 1

操作步骤

1、将所有需要批量提交的算例放到一个文件夹下面的子文件夹中
结构示例：

其中test2 为批量提交作业的文件夹，1-4代表提交作业子算例文件夹
2、将上述中第一个脚本放置在 test2 下默认为1.sh ，将准备好的算例提交脚本run.slurm 也放置在test2 下
结构示意：

3、执行 1.sh
source 1.sh
4、脚本解析

1 遍历当前文件夹下所有文件
2 判断是否为文件夹
3 复制提交脚本到子算例文件夹下
4 添加提交脚本执行权限 提交作业
注意：
一个子算例文件夹 放置一个算例
需要指定输入文件的 提交脚本 需要进行修改