GAMESS

General Atomic and Molecular Electronic Structure System (GAMESS) 是一款分子层面的从头算量子化学程序。GAMESS可用于计算RHF、ROHF、UHF、GVB乃至MCSCF的SCF波函数。其中针对这些SCF波函数的关联修正包括组态相互作用、二阶微扰、耦合团簇方法和密度泛函理论近似。软件可通过CI、EOM及TD-DFT(含时密度泛函)计算激发态。同时,原子核梯度方法在结构自动优化、过渡态搜索或反应路径追踪功能实现上也是可用的。通过能量hessian计算,软件可以预测振动频率、IR或拉曼强度。借助于离散有效片段势(discrete Effective Fragment potentials)或极化连续体模型等连续体模型,软件能够模拟溶剂效应。软件还能从事多种相对论计算,包括有限阶的二组分标量相对论修正(可考虑多种自旋轨道耦合方式)。值得一提的是,软件的分子轨道方法将计算划分为许多小片段,使得上述这些复杂处理方法可用在非常庞大的体系当中。此外,原子核波函数也是可以计算的,包括利用VSCF,或利用NEO代码对原子核轨道进行精细处理。
GAMESS可以计算许多分子性质,从简单的偶极子矩到依赖于频率的超极化率都属于GAMESS可研究的范围。GAMESS内存储了大量基组及有效核势、模型核势,其研究对象涵盖了几乎整个元素周期表。

一、脚本模板

#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=1                   # 节点数量
#SBATCH --ntasks-per-node=56        # 每个节点核心数量
#SBATCH --ntasks=56                 # 总核心数
#SBATCH --partition=g1_share        # 队列分区且必须指定正确分区
#SBATCH --job-name=hello             # 作业名称
#SBATCH --output=hello.%j.out        # 正常日志输出 (%j 参数值为 jobId)
#SBATCH --error=hello.%j.err         # 错误日志输出 (%j 参数值为 jobId)

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#          Software Envrironment             #
##############################################
unset I_MPI_PMI_LIBRARY                        # 取消默认mpi库,使用intel自带
export I_MPI_JOB_RESPECT_PROCESS_PLACEMENT=0   # intel 多节点作业所需修改参数
module load intel/2022 intelmpi/2022           # intel 环境加载

##############################################
#               Run job                      #
##############################################
export OMP_NUM_THREADS=1

./runall  00  >&  runall.log

作者:admin  创建时间:2023-03-16 09:59
最后编辑:admin  更新时间:2024-09-05 11:17