ABAQUS

ABAQUS 是一种有限元素法软件

用于机械、土木、电子等行业的结构和场分析。

请自行购买ABAQUS license许可，下载和安装。如需协助安装或使用，请联系我们，附上课题组拥有ABAQUS license的证明。

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一、脚本模板

#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=1                   # 节点数量
#SBATCH --ntasks-per-node=56        # 每个节点核心数量
#SBATCH --ntasks=56                 # 总核心数
#SBATCH --partition=g1_share        # 队列分区且必须指定正确分区
#SBATCH --job-name=hello            # 作业名称
#SBATCH --output=hello.%j.out       # 正常日志输出 (%j 参数值为 jobId)
#SBATCH --error=hello.%j.err        # 错误日志输出 (%j 参数值为 jobId)
   
##############################################
#          Software Envrironment             #
##############################################
unset I_MPI_PMI_LIBRARY                        # 取消默认mpi库，使用intel自带
export I_MPI_JOB_RESPECT_PROCESS_PLACEMENT=0   # intel 多节点作业所需修改参数 
# module load intel/2022 intelmpi/2022           # intel 环境加载
   
##############################################
#               Run job                      #
##############################################
ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited
nameflag=`scontrol show hostname $SLURM_JOB_NODELIST`
beginflag="mp_host_list=["
endflag="]"
for line in $nameflag
do
tempflag="['$line',56],"
beginflag=$beginflag$tempflag
done
eflag=`echo $beginflag | sed 's/.\{0\}.$//'`
endflag=$eflag$endflag
echo $endflag > abaqus_v6.env
   
# JOBNAME=`ls | grep inp | sed 's/.\{3\}.$//'`
JOBNAME=test_test
   
# For program
#USERNAME=huang.for
   
# change scratch to the actual directory
#abaqus job=${JOBNAME} user=${USERNAME} input=${JOBNAME}.inp globalmodel=zd.odb  cpus=$SLURM_NPROCS scratch=./ interactive
   
abaqus job=${JOBNAME} input=${JOBNAME}.inp analysis  cpus=$SLURM_NPROCS scratch=$SLURM_SUBMIT_DIR interactive

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二、命令行各个参数意义如下

- job=${JOBNAME}：指定作业名称为环境变量JOBNAME的值。
- input=${JOBNAME}.inp：指定输入文件名称为环境变量JOBNAME的值加上后缀名.inp。
- analysis：指定要执行的分析类型。
- cpus=$SLURM_NPROCS：指定使用的CPU数量为环境变量SLURM_NPROCS的值。
- scratch=$SLURM_SUBMIT_DIR：指定工作目录为环境变量SLURM_SUBMIT_DIR的值。
- interactive：指定以交互模式运行。

三、例运行报错问题

##报错内容如下
warning, dlopen of libhwloc.so failed (null)/lib/linux_amd64/libhwloc.so: cannot open shared object file: No such file or directory 

### 报错提示如上：
### 作业现象： 提交后作业报错立即杀死作业
### abaqus 2016 出现此报错 其他版本没发现 通过提交脚本添加 unset SLURM_GTIDS

#提示计算节点执行hostname 失败
nopasswd 
#做一个免密