topas

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TOPAS 包装并扩展了 Geant4 模拟工具包，使医学物理学家更容易使用各种形式的放射治疗的高级蒙特卡罗模拟。 TOPAS 可以对 X 射线和粒子治疗治疗头进行建模，基于 CT 图像对患者几何形状进行建模，对剂量、能量等进行评分，保存和回放相空间，提供高级图形，并且是全四维 (4D)处理治疗期间光束传输和患者几何形状的变化。 TOPAS 用户配置预先构建的组件（例如喷嘴、患者几何形状、剂量测定和成像组件）来模拟各种放射疗法，而无需了解底层 Geant4 模拟工具包或任何编程语言。模拟的所有方面，包括所有 4D 行为，都由独特的 TOPAS 参数控制系统控制。

一、脚本模板

 #!/bin/bash
 #SBATCH --nodes=1                   # 节点数量
 #SBATCH --ntasks-per-node=56        # 每个节点核心数量
 #SBATCH --ntasks=56                 # 总核心数
 #SBATCH --partition=g2_share        # 队列分区且必须指定正确分区
 #SBATCH --job-name=hello            # 作业名称
 #SBATCH --output=hello.%j.out       # 正常日志输出 (%j 参数值为 jobId)
 #SBATCH --error=hello.%j.err        # 错误日志输出 (%j 参数值为 jobId)

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 #          Software Envrironment             #
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 unset I_MPI_PMI_LIBRARY                        # 取消默认mpi库，使用intel自带
 export I_MPI_JOB_RESPECT_PROCESS_PLACEMENT=0   # intel 多节点作业所需修改参数
         # intel 环境加载

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 #               Run job                      #
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topas view.txt